Меню
Главная
Авторизация/Регистрация
 
Главная arrow Информатика arrow БИОИНФОРМАТИКА

БИОИНФОРМАТИКА

ПРЕДМЕТ БИОИНФОРМАТИКИ Макромолекулы - носители информации в клетке Информация на клеточном уровне Структура ДНК. Азотистые основания Структура РНК Структура белков Информационные матричные процессы на молекулярном уровне Репликация Транскрипция Процессы модификации РНК. Сплайсинг Трансляция Формирование пространственных структур ДНК. Структура ДНК-белковых комплексовУпаковка эукариотической ДНК. Формирование пространственных структур РНК Формирование пространственных структур белков Междисциплинарный характер биоинформатики Задачи биоинформатики Геномика Протеомика Молекулярная филогенияВопросы и задания для самопроверкиЛитература к главе 1 МАТЕМАТИЧЕСКИЙ АППАРАТ БИОИНФОРМАТИКИ Простые статистические модели в биоинформатике Метод скользящего окна Применение теоретико-информационного подхода Алгоритмы выравнивания последовательностей Алгоритм глобального выравнивания последовательностей Алгоритм локального выравнивания последовательностей Варианты реализации штрафующей функции за пропуски в выравнивании Алгоритмы множественного выравнивания последовательностей Марковские цепи и скрытые модели Маркова Марковские цепи Скрытые модели Маркова Алгоритмы, применяемые при работе со скрытыми моделями МарковаАлгоритм Витерби. Искусственные нейронные сети Одиночный нейрон Обучение нейрона Иерархические сети, многослойный пецептрон Сеть Хопфилда Самоорганизующиеся карты Байесова статистика Классическая и байесова вероятности. Байесов вывод Формула Байеса для непрерывных распределений Симуляция Монте-Карло и алгоритмы имитации отжига Симуляция Монте-КарлоВыборка с отклонением значений. Методы Монте-Карло, использующие марковские цепи Алгоритм имитации отжига Эволюционные и генетические алгоритмы Общие принципы Эволюционные алгоритмы Чередование поколений в эволюционных алгоритмах Оценка и ранжирование особей согласно степени их «приспособленности» Способы отбора особей Воспроизводство особей Генетические алгоритмы Алгоритмы кластерного анализа Введение в кластерный анализ Примеры алгоритмовВопросы и задания для самопроверкиЗадачиЛитература к главе 2 ПРИМЕРЫ МОДЕЛЕЙ В БИОИНФОРМАТИКЕ Общие модели Сравнение последовательностей биологических полимеров Точечные графики и матрица выравнивания Методы быстрого поиска в базах данных Статистическая оценка значимости значений оценочной функции при выравнивании последовательностей Применение скрытых моделей Маркова для идентификации последовательностей Представление входных данных и интерпретация результатов в моделях, основанных на искусственных нейронных сетях Логотипы последовательностей. Информационно-теоретическая интерпретация консервативных участков последовательностей биологических полимеров Геномика - примеры моделей Поиск открытых рамок считывания. Поиск кодирующих фрагментов Предсказание оперонной структуры прокариотических геномов Предсказание вторичной структуры молекул РНК Протеомика - примеры моделей Профили аминокислотных последовательностей, позиционно- зависимые матрицы замещенияБыстрый поиск в базах с использованием профилей. PSIBLAST. Предсказание наличия сигнальных пептидов в исследуемой последовательности Применение сети Кохонена для ускорения поиска в базе Предсказание вторичной структуры белков Предсказание трансмембранных фрагментов белков Моделирование структуры белка в свете информационных технологий Подходы к решению проблемы моделирования пространственной структуры белка. Задача сравнительного моделирования структуры белка ио его аминокислотной последовательности Альтернативные способы подбора матричной структуры Эволюционные модели Множественные выравниванияАлгоритм ClustalW. Построение филогенетических деревьевАлгоритмы, оперирующие матрицей расстояний.Вопросы и задания для самопроверкиЛитература к главе 3 БИОЛОГИЧЕСКИЕ БАЗЫ ДАННЫХ Основы структур баз данных Базы данных, содержащие информацию о биологических структурах и последовательностях Основные форматы данных биоинформатики Каталог известных баз данных БИОИНФОРМАТИЧЕСКИЕ ПРОГРАММЫ И СЕРВИСЫ Анализ последовательностей биологических полимеров Расширенный поиск с применением алгоритмов семейства BLAST Предсказание физико-химических свойств белков на основании аминокислотных последовательностей Поиск белков, обладающих сходными физико-химическими свойствами Предсказание особых типов структур и свойств белков Каталог репозиториев веб-сервисовВопросы и задания для самопроверки к главам 4 и 5ЗадачиЛитература к главам 4 и 5 КВАНТОВЫЙ МИР И БИОЛОГИЯ - ДВЕ СУЩНОСТИ ОДНОЙ И ТОЙ ЖЕ РЕАЛЬНОСТИ Информация и вычисления: от классического компьютинга к квантовому Что представляет собой информация — попытка определения Классическая информация и вычисления Квантовая информация и вычисления Сознание как проявление квантового мира и человеческий мозг в качестве квантового компьютера Квантовая информация и работа сознания находят друг друга Одна проблема: как совместить локальность и нелокальность Пути преодоления противоречий. Грани нелинейности: логика, множества, числа Фрактальнаяр-адическая феноменология единства естественных систем Радическая система разбирается не только в работе сознания, но и в конформациях белков Спин - носитель квантовой информации Квантовый спин и фаза Триплетные и синглетные состояния Спин заставляет спирали ДНК закручиваться в спиральВопросы и задания для самопроверкиЛитература к главе 6
 
Если Вы заметили ошибку в тексте выделите слово и нажмите Shift + Enter
РЕЗЮМЕ Следующая >
 

Популярные страницы